一、 天然營養鏈被農藥切斷
植物跟昆蟲在過去千萬年來就是各地區長期生物演化下來的結果，事實上沒有在自然界沒有所謂的害蟲或益蟲，任何蟲在植物上活動，都會帶給植物增加一種叫做甲殼素的營養素。當昆蟲停留在農作物等植物的葉子上時，植物會釋放出幾丁質酶、幾丁聚醣等多種酵素，植物從昆蟲足部或接觸部位中吸收微量的甲殼素，變成植物本身有益的營養素，同時昆蟲也可以食用此植物，維持其生命。千萬年來昆蟲與植物的自然營養鏈早就演化成一個密不可分的結構，但在近代，由於人類為了獲得更高的農作物收益，不希望農作物長蟲，把有利於作物的生長的叫做益蟲，不利於農作物生長的叫做害蟲，針對人類定義的害蟲大量施用化學農藥的結果，切斷了這種天然的營養鏈，這樣的作法，也慢慢造成了現在的農作物有著過多的有害化學物質，重金屬、農藥殘留、逐年降低的作物營養成分，也造成逐漸失去生命能量的貧瘠土地日漸增多。
二、 台灣的農業用水雖然不會向生活用水含有大量的氯氣，但是上游或周邊的工廠污染（重金屬污染、化學物質污染）、農藥、河川污染（養豬廢水污染）、垃圾廢棄物的堆放，家庭生活排水等，卻造成了農業安全用水一個很大的隱憂’.
最近的調查發現：環保署2008年從汙染潛勢較高的桃園縣、新竹市、台中縣、彰化縣，選出45條渠道，採樣灌溉水質，發現底泥汙染最嚴重，41%超過標準；農地土壤重金屬18%超過標準；灌溉水質13%超過標準。台灣的農地污染其實比民眾想像的嚴重。
人體的機制跟植物相同，如果有好水，好水透過所謂的水合作用(Hydration)是可以在某種程度上達到帶入植物營養並淨化廢物與毒素的作用，可惜的是當這種本具有淨化的水，本身也受污染，就會讓原本應該充滿營養的植物，也同時帶有我們意料不到的毒素，也就是說我們想的天然蔬果並沒有我們想的那樣天然無害。
三、 溫室栽培的缺失（大棚種植）
搭建溫室最常用的塑膠布具有遮斷太陽光的功能。植物透過光合作用來成長，光合作用需要日光，日光中有強烈的紫外線，紫外線會迫使植物接受強烈的自由基，促進植物氧化，植物為了保護自己在演化的結果下，體內能產生大量的抗氧化物質。這些抗氧化物質包含了維生素A、C、E、高達數千種的生物類黃酮物質、異黃酮、兒茶素等多酚物質，這些抗氧化物質成了近代食品保健中，不斷被研究、提取作為抗老化、提振生命功能的重要元素成分。
這些抗氧化物質源自於日光中的紫外線，如果因為塑膠布遮斷了太陽光，讓紫外線減少，換句話說植物自然產生的這些大量有益的抗氧化物質也會隨之減少，我們並無從得知我們購買的蔬菜水果來自於哪種種植方式，但越來越多的科學研究發現植物的營養成分不同以往。我們人體需要這種具有能量高度抗氧化物質的健康植物，那才能培育我們維持強韌而健康的生活。
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